Мордор был защищён с трёх сторон горными цепями, устроенными примерно прямоугольно:Еред Литуи на севере,Ефель Дуат (или Изгарные Горы) на западе и на юге. В северо-западной части Мордора глубокая долина Удун была единственным входом для больших армий, и это то место где были построены Чёрные Ворота Мордора.Эти ворота были построены Нуменорцами с целью удерживать зло в пределах Мордора. Башни помещенные позади Черных Ворот (их называют Клыками Мордора), были построены Гондором, чтобы укрепить Мородор. Перед Мордором лежит огромноеДагорладское поле. Главная крепость Саурона Барад-дур была в предгорьях Еред Литуи. К юго-западу от Барад-Дура лежит засушливое плато Горгорот, юго-восточнее, у солёного моря Нурнен, лежит ещё одно крупное плато-Литланд. Узкий перевал, через Изгарные горы охраняла крепость Минас Моргул (ранее Минас Итиль).Перевал называется Кирит Унгол. Еще более трудный проход охранялся гигантским пауком Шелоб.

Южная часть Мордора была намного более плодородная, и достаточно влажная, таким образом позволяющее вести сельское хозяйство. В этой части Мордора располагалось солёное море Нурнен.

К западу от Мордора располагалась узкая полоса земли Итилия, за которой был город Осгилиат и большая река Андуин.

Флора Мордора — последние растения, сумевшие выжить в этой «умирающей, но еще не умершей» стране (Властелин Колец). Включает в себя «низкорослые деревца», «пучки жесткой серой травы», «сморщенные мхи», «заросли ежевики» и густо растущие кустарники, которые можно было найти около крохотных ручейков, капавших из долин наверху. Сэм и Фродо укрылись за такими кустами ежевики, у которых были длинные острые шипы и крючковатые колючки. Кустарники также имели шипы, которые Сэм описывает как «длиною в фут».